O JHFP apresenta várias vantagens:
- Acesso a um instrumento de financiamento flexível, que permite a mobilização de agentes públicos, privados e parcerias público-privadas;
- Garantia de que as intervenções apoiadas são estruturantes;
- Possibilidade de utilizar financiamento proveniente do JHFP (canalizado através de UDF) para financiar a parte não financiada de projectos que tenham sido ou venham a ser objecto de subsídios comunitários.